1992 yılında Çok Programlı Lise olarak açılması için İlçe Milli Eğitim Müdürlüğü tarafından Türkiye Diyanet Vakfından talep edilmiş, fakat yapılan yazışmalarda ancak bağımsız bir İmam Hatip Lisesi veya Ankara Yenimahalle Merkez (Tevfik İleri) İmam Hatip Lisesinin bir şubesi olarak açılmasının uygun olacağı bildirilmiştir.

1992–1993 Eğitim Öğretim yılından itibaren Ankara Yenimahalle (Tevfik İleri) İmam Hatip Lisesi Gölbaşı Şubesi olarak öğretime açılmıştır. Daha sonra Milli Eğitim Bakanlığı Din Öğretimi Genel Müdürlüğünün 11.12.1995 tarih ve 349/6450 sayılı yazısı ile 1995–1996 öğretim yılından itibaren müstakil hale dönüştürülmüştür. Okulumuz, 1998–1999 öğretim yılında dört şubeden 113 öğrenci olarak ilk mezunlarını vermiştir. Kısa sürede öğrenci mevcudu 1300 civarına çıkınca, mevcut binası ihtiyacı karşılayamadığı için Okul Koruma Derneği ek bina yapımına karar vermiş ve 1998–1999 yılları arasında da bitirmiştir. Ortaokul ve Liseyi bünyesinde bulunduran okulumuz, sekiz yıllık kesintisiz eğitim uygulamasının başlaması ile genel mevcudu 550 civarına kadar düşmüştür. Bu durumda ana bina, eğitim öğretim açısından ihtiyacı karşıladığı için ek bina ihtiyaç fazlası olarak kalmıştır. Mevcut binaların değerlendirilmesi için Devlet Parasız Yatılı olması yönünde müracaat yapılmış ise de yapılan teftiş sonucu uygun görülmemiştir. Aynı yıl Gazi Üniversitesinin binasında faaliyet gösteren Sağlık Meslek Lisesinin üniversite kampüsünden çıkartılması ve Sağlık Bakanlığının da söz konusu okulu yerleştirecek bir bina bulamaması nedeniyle Bâlâ Sağlık Meslek Lisesi ile birleştirme kararı alması üzerine, zamanın Kaymakamının huzurunda Dernek yöneticileri ile ilgili okulun yöneticileri arasında yapılan 15.07.1999 tarihli protokol ile geçici bir süre için ek bina Sağlık Meslek Lisesine verilmiştir. Daha sonra Okulumuzun ana binasının bir bölümünde Milli Eğitim Bakanlığı Özel Eğitim Rehberlik ve Danışma Hizmetleri Genel Müdürlüğünün 12.06.2002 tarih ve 2478 sayılı yazısı ile Gölbaşı Rehberlik Araştırma Merkezin hizmet vermesi uygun bulunmuştur.

2006–2007 Öğretim yılında da Okulumuz bünyesinde aynı müdürlüğe bağlı olarak Anadolu İmam Hatip Lisesi eğitim ve öğretime başlamıştır. Okulumuz 2011-yılında Eymir Mahallesi Toki Bloklarındaki 40 derslikli yeni binasına taşınmıştır. Okulumuz bünyesinde 2012-2013 eğitim öğretim yılından itibaren İmam Hatip Ortaokulu açılmıştır.

2015-2016 Eğitim ve Öğretim Yılında (07.12.2015 tarihinde) Şehit Sebahattin Koçak Anadolu İmam Hatip Lisesinden ayrılarak, Ankara Gölbaşı Mehmet Akif Ersoy Anadolu İmam Hatip Lisesi adını almıştır. Mehmet Akif Ersoy Anadolu İmam Hatip Lisesi bünyesinde İmam Hatip Ortaokulu bulunmaktadır. Okulumuzda, 24 derslik, Pansiyon, 2 FKB Laboratuvarı, BT Laboratuvarı, Kütüphane, Mescid, Şark Odası, Konferans Salonu, Spor odası, Yemekhane, Okul Aile Birliği Odası, Destek Hizmetleri Odası gibi mekânlarda  öğrencilerimize eğitim ve öğretim hizmetleri verilmektedir.

Okulumuz bünyesinde Açık İmam Hatip Lisesi bulunmaktadır.

2020-2021 Eğitim Öğretim Yılından itibaren Proje Okulu bünyesine alınmıştır.